食用菌不仅营养丰富，味道鲜美，同时还具有明显的保健功能。因为食用菌都含有特异性的真菌多糖和三萜类等多种活性物质，经研究和实践证明，食（药）用菌对提高人体免疫功能、防病治病、促进人体健康有重要作用。著名营养学家洪昭光曾在上海第五届国际食用菌学术讨论会上说：“食用菌的预防保健作用，胜过半个医生。”有一位经常给“农科热线”来电话和多次登门咨询的栾女士，听了专家建议后，经常吃黑木耳等食用菌食品，原来体弱多病，现在已有三年多未进医院看过病，她说：“我把看病的钱用来参加旅游和锻炼身体，充分享受老年人的生活乐趣。”

食用菌的保健功能主要是可以提高人体免疫力、调节生理代谢、预防疾病、延缓衰老等。近年医药研究表明，食用菌具有抗肿瘤、降血压、降血脂、降胆固醇、清除血液垃圾、软化血管、抗血栓、保肝、健胃、补肾、排毒等功能。

食用菌作为保健食品，除了直接煮成各种美味菜肴进行食疗外，一些药用菌如灵芝、冬虫夏草、茯苓、天麻等都是著名的中药。目前，市场上已经出现多种食用菌和药用菌加工产品，及其有效成分的提取物，许多保健产品名目繁多，据说仅以灵芝为原料制成的保健品就有280多种。