木耳有清肺解毒作用。在选购时应该注意个体均匀，色泽黑褐，耳形好，耳脉分明，无杂质。目前市场上出现一种劣质木耳。将木耳泡水后，染上黑色颜料，晒干后上市。另有一种“地耳”耳片薄、肉质硬，也很易混在木耳一起，泡水后就能够识别出来。消费者容易上当，切勿在小摊贩中购买。

木耳一般以温水或冷水发泡，再用清水冲洗。木耳也有软木耳和硬木耳的分别。前者质地比较滑嫩，体型较小，比较容易吸水，只要把干品放在热水中，待自然吸足水分即可；而硬木耳，也称毛木耳，体形较大，质地粗糙。木耳干料放在热水中，可采用煮、焖、蒸的加热方法来使其吸收水分。目前上海市场的木耳有两大类。一类来自东北的木耳，朵大似花，水发性能很好，口味佳；另一类来自浙江等地，朵小肉厚，吃口好，称单片木耳，品质上佳。

新鲜木耳不宜食用，因为新鲜木耳含有卟啉类光敏物质，食用后，身体被太阳照射到的部位可引起日光性皮炎，出现瘙痒、疼痛、水肿等症状。