番茄根腐病又称番茄疫霉根腐病。发病初期于茎基部或根部产生褐斑，逐渐扩大后凹陷，严重时病斑绕茎基部或根部一周，使地上部逐渐枯萎。纵剖茎基或根部，导管变成深褐色后根茎腐烂，不长新根，植株枯萎而死。在结果期也可引起绵疫病为害。

根腐病的病菌随病株残体在土壤中越冬，也有可能在未充分腐熟的堆肥中越冬，翌年产生大量分生孢子，经雨水或灌溉水传播为害，在高温、高湿或地温偏低时有利于发病。番茄定植后如果遇到地温低、土壤湿度过高，且持续时间长，或连续阴雨大棚内未能及时通风，形成棚内温度高、湿度大，特别是大水漫灌后，通风不及时，会导致该病的发生、流行。

防治根腐病的方法有以下几种。

（1）实行轮作。选择地势较高、排水良好的疏松土壤，做到深沟高畦，确保雨后田间不积水，重病地区与非茄果类蔬菜进行3年轮作。

（2）选用无病菌土壤育苗，培育无病菌壮苗。

（3）地膜覆盖。尽量避免病原菌通过雨水或灌溉水溅到番茄叶片或果实上。

（4）加强田间管理，及时整枝，清除病叶和病果，并集中深埋或烧毁，改善田间通风环境。

（5）发现病株要及时喷洒农药防治。常用农药可选用：72％克露可湿性粉剂600倍液，40％三乙磷酸铝（乙膦铝）可湿性粉剂200倍液，58％甲霜灵·锰锌可湿性粉剂500倍液，64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液，72.7％普力克水剂800倍液，70％乙磷·锰锌可湿性粉剂500倍液，50％甲霜铜可湿性粉剂600倍液，60％琥·乙膦铝（DTm）可湿性粉剂500倍液等喷洒植株茎基部和地面，同时用药剂灌根效果更好。