根据种植方式，上海芹菜有直播芹菜和移栽芹菜两种，两者除草方式略有不同。

一般直播芹菜相对移栽芹菜耐药性较强，可适用的除草剂品种较多，安全系数也相对较高。目前可供选用的药剂有33％施田补（除草通）乳油、48％敌草胺乳油、25％草灵乳油。具体使用方法如下。

（1）施田补。用33％施田补乳油100～150毫升/亩，加水40～50千克/亩。在芹菜播后苗前均匀喷雾在土壤表面。如果是砂质土壤，应选用低剂量，并在盖帘或遮网前用药。

（2）敌草胺。用48％敌草胺乳油100～150毫升/亩，加水40～50千克/亩。在芹菜播后苗前均匀喷雾在土壤表面。所不同的是，该药剂见光易分解，喷雾后应在土壤表层浅混土覆盖。

移栽芹菜可供选择的除草剂品种及用水量与直播芹菜的相同，但亩用药量不得高于125毫克，使用时间应掌握在整地后移栽前1～3天。砂质土壤用药量应适当减少。

用药后的芹菜田，若仍有禾本科杂草发生，可在杂草2～4叶期选用防除禾本科杂草的专用除草剂12.5％盖草能或75％禾草克等进行叶面喷雾。使用剂量均为50～75毫升/亩，加水40～50千克/亩。