番茄生产过程中，出现植株萎蔫的原因有生理性缺水、青枯病、枯萎病等。因生理性缺水而造成的番茄茎秆中空和萎蔫的现象多发生在寒冬低温季节。番茄根系生长最适土温为20～22℃，9～10℃时根毛停止生长，土温降至5℃时，根系吸收水分、养分的能力受阻。当遇到晴天特别是早晨太阳出来时，棚内温度迅速升高，而根系却难以迅速吸水，就会造成植株萎蔫。这种生理性缺水造成的番茄茎秆中空和萎蔫一般在年后随着气温的升高，根系恢复正常生长后症状会减轻。

因青枯病和枯萎病引起的植株萎蔫则不同，往往会给番茄生产带来极大为害，造成减产，甚至绝收。青枯病和枯萎病的发生、症状有如下区别。

（1）病菌不同。番茄青枯病是细菌性病害，番茄枯萎病是真菌性病害。横切番茄青枯病病茎，用手挤压切面上会溢出白色菌液，无黏状物；横切番茄枯萎病病茎，切面上挤压后无菌液，潮湿时病基部有粉红色黏状物。

（2）发病生育期不同。番茄青枯病一般在番茄株高30厘米左右（成株期）开始发病，而番茄枯萎病则一般是在番茄开花结果期开始发病。

（3）萎蔫现象不同。番茄青枯病的病株白天萎蔫，傍晚可以恢复；番茄枯萎病白天萎蔫，傍晚不会恢复。番茄青枯病植株枯死，叶片不变色，仍保持绿色，而番茄枯萎病枯死后，叶色变黄。

（4）病程不同。番茄青枯病病程进展迅速，严重的病株经7～8天即整株死亡；番茄枯萎病病程进展缓慢，病株一般要经15～30天才枯死。

（5）病菌越冬形式不同。番茄青枯病病原细菌主要是随病残体留在田间，所以重茬田积累的菌量越大，发病越重；番茄枯萎病病菌以菌丝体或厚垣孢子随病残体在土壤中或附着在种子上越冬。