用发酵料及熟料都可以，但依据气候与环境条件以熟料更为稳妥，可避免杂菌过多的污染，以保证经济收益。

发酵料及熟料各具特点。发酵料工艺简单、不需设备、不耗能源，通过发酵料堆积时产生的高温杀死料内的大部分杂菌害虫，并使培养料的养分转化，利于平菇菌丝的发菌，是一种值得推广的方法。但应掌握适宜的季节（气温在25℃以下），原料新鲜（经日光暴晒2～3天），配料科学（有机氮源不超过15％），发酵彻底（料堆上插通气孔，每隔20厘米插1孔，利于通气发酵）。发酵结束后，要求达到料有芳香味，并有大量白色放线菌产生，pH在7～7.5。

熟料指常压或高压灭菌后的培养料，要投入一定的设备，成本稍高，但杀菌较彻底，不易发生污染，在南方暖湿地区更为适合。在农村，大多是以常压灭菌为主，投入成本比高压灭菌低，一般以100℃、达12小时以上为宜。并要求锅内的菌种袋以“井”字形排放，袋与袋之间有一定的间距，保证袋的中心达到杀菌温度为佳。建议在制作菌种时，周围的环境保持干净、干燥、清洁卫生，减少污染源，并喷洒2％甲醛和0.2％敌敌畏消毒、杀虫，以保证菌种的成品率。