常压灭菌至少要保持8小时以上，时间越长越好，主要是要使100℃以上的温度渗透到达菌袋培养料的中心。灭菌的时间长短还与菌袋的排列有关，如果能排成“井”字形，袋与袋之间有空隙，使热量能及早渗入培养基的中心，则效果更好。