液体菌种是食用菌菌种生产工艺的一大改革。在国外，日本、韩国等国的大型现代化生产企业，几乎全部用液体发酵生产菌种，所以液体菌种的前途看好。

我国目前工厂化大型企业应用液体菌种的仅上海天厨菇业有限公司一家成功的，说明我国食用菌企业在运用这一先进性技术方面还有不少问题。问题主要是液体菌种设备投入高、技术要求高、企业的环境条件好，以及设备性能要好。另一个原因是液体菌种在千家万户的农民中推广难度大，菌种保存时间短，否则极易变质，所以在农村中要用液体菌种的基本条件不具备。在农村中有条件的地方可搞小型摇床，搞些成熟度较高的金针菇、北虫草等液体菌种，自产自用比较实惠。