蘑菇的菇体发黄，主要是因为菇棚漏雨，蘑菇的培养料受雨水的影响，料内的含水量过高，造成蘑菇的菌丝窒息，使得菌丝萎缩（俗称“退菌”），影响了料内养分向菇体输送，最后导致菇体发黄，逐渐软蔫死亡。菇农称：“蘑菇菌丝干不死，湿要死”，就是这个道理。
建议采取以下措施。
（1）将黄萎的蘑菇及时摘除，防止其在菇床上腐烂而造成杂菌污染。
（2）及时开启门窗，进行菇房大通风，地面撒干石灰粉，尽快把菇房的湿度降下来，营造良好的干燥环境。
（3）及时进行料内打扦，用竹竿从培养料底自下而上打扦，并摇动，使料内的洞穴呈下面口大上面口小的圆锥形。每隔6～8厘米打一个洞，呈梅花形分布。
经过以上处理4～5天，蘑菇菌丝会快速恢复，长出新生的绒毛菌丝。
