鸡气囊炎病变常常是由一种或多种病原混合感染引起的，常见的病原有大肠杆菌、鸡毒支原体、曲霉菌、鸡传染性支气管炎病毒、鸡鼻气管鸟杆菌等。

大肠杆菌病：通常可见气囊壁增厚、混浊，严重的有干酪样物质附着。此外，还可见到纤维素性心包炎、肝周炎、腹膜炎等。

鸡毒支原体病：主要见到气囊壁混浊、增厚，表面有结节性病灶，内含干酪样物。同时可见鼻、气管、支气管和气囊内有黏性或干酪样渗出物，常继发其他病原感染。

曲霉菌病：气囊内含有灰白色或黄白色干酪样渗出物。此外气囊、肺和胸腹腔浆膜上可见米粒大的灰白色或黄白色的霉斑结节。

鸡传染性支气管炎：气囊混浊或含有黄白色干酪样渗出物。同时气管下段、支气管、鼻腔和窦内有浆液性或炎性渗出物；肾型还会呈现肾肿大、苍白，呈斑驳的“花斑肾”。

鸡鼻气管炎鸟杆菌感染：主要见气囊炎、支气管炎及肺炎。腹气囊或胸气囊纤维性炎症，气囊内有稠厚、黄色泡沫样渗出物。

以上几种病必须通过实验室诊断才能确诊。