各地区养鸡场的免疫程序，应根据当地的实际情况制定。在制定免疫程序时，应考虑到本地区的疫病流行情况、畜禽种类、日龄、饲养管理水平、母源抗体的干扰，以及疫苗的性质、类型、免疫途径等方面的因素。其他饲养场或专业书中的免疫程序只能作为参考，即使是本场的免疫程序，也不能固定不变，应根据应用的实际效果，随时进行合理的调整。血清学抗体监测是重要的参考依据。

对于中小散养户来说，首先要考虑新城疫和传染性法氏囊病的免疫，而且都要考虑母源抗体的干扰。用血凝抑制试验（HI）测定1日龄雏鸡的新城疫母源抗体水平，以此推算首免日龄，母源抗体的半衰期为4.5天。如果1日龄雏鸡的新城疫母源抗体低于1∶16，1日龄就应首免。没有条件的饲养户，4～6日龄给雏鸡滴眼或滴鼻1羽份活苗，9～11日龄用油佐剂灭活苗颈部皮下接种0.3羽份，半个月之后再免疫1次活苗。对于法氏囊疫苗的免疫，母源抗体水平较高时，在14～18日龄时饮水免疫1羽份，无母源抗体的雏鸡，应提前免疫。

目前，为了预防高致病性禽流感，必须接种禽流感亚型H5灭活苗，可参考政府职能部门制定的免疫程序进行免疫。

饲养黄鸡的养殖户，由于饲养周期长，还应该考虑1日龄马立克病疫苗的免疫。否则，饲养后期发生马立克病，损失也会相当惨重。目前正规的孵化场在出壳的第1天均对苗鸡进行马立克病疫苗的免疫注射。